1. 所有牙石表面均覆盖一层菌斑；
2. 龈上牙石妨碍刷牙及牙间隙的清理；
3. 龈下牙石使龈下清洁变得困难，且在菌斑生物膜形成初期可作为细菌定植中心；
4. 龈下牙石能够吸收细菌内毒素；
5. 龈上、下牙石可能使牙周探诊产生误差。
基于上述原因，尽管某些孤立残留的龈下牙石可能已经不影响牙周愈合，但尽可能地去除牙石仍然很重要。一些研究结果亦与此一致，表明即便在牙周手术中可直视情况下亦难将根面的牙石完全绝对去尽。探诊深度超过5mm的牙周袋很难保证没有牙石和菌斑，因此牙周治疗时不应忽略根面残留的沉积物，而应尽量重视它，这一点非常重要。
